基本信息
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Bio
国家自然科学基金委“优青”获得者(2018),教育部新世纪优秀人才(2012),华中学者特聘岗;
主要研究成果:在数据库构建、miRNA和转录因子共调控网络分析、癌症基因组挖掘和细胞外囊泡调控等方面有深入研究。围绕转录因子和非编码RNA建立了一系列有一定国际影响的数据库,如AnimalTFDB、hTFtarget、miRNASNP、lncRNASNP和EVmiRNA等(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/),其中AnimalTFDB和miRNASNP各被引用300多次。发展了转录因子和miRNA在复杂疾病中的共调控模块和网络研究(FFLtool),运用该方法发现了白血病和肿瘤微泡等研究中的重要调控因子。开发了基因集的癌症多组学分析平台GSCALite、特异表达基因工具SEGtool、T细胞丰度预测方法ImmuCellAI、癌症细胞系鉴定方法CCLA和TCR丰度预测方法CATT等。
发表论文70余篇,总引用5000余次(google)。近5年来以通讯作者在Nucleic Acids Research、Cancer Research、Cell Reports、Theranostics、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics等权威期刊发表论文近30多篇,包括多篇ESI高被引论文(2019.12月ESI网站显示高被引通讯作者论文3篇)。
2011年以来,先后主持国家自然科学基金5项,参与科技部重大项目2项。在国际上最大的计算生物学会议ISMB和全国各级生物信息大会做过邀请报告。担任系统生物学分会、医药生物信息技术分会、血液病精准诊疗专业委员会、中国抗癌协会非编码肿瘤标志物分会肿瘤测序与大数据分析专委会等多个协会委员、常委等。担任自然科学基金生命学部、医学部函评评委和精准医学重点研发会评评委。担任Scientific Reports等多个杂志的编委。
主要研究成果:在数据库构建、miRNA和转录因子共调控网络分析、癌症基因组挖掘和细胞外囊泡调控等方面有深入研究。围绕转录因子和非编码RNA建立了一系列有一定国际影响的数据库,如AnimalTFDB、hTFtarget、miRNASNP、lncRNASNP和EVmiRNA等(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/),其中AnimalTFDB和miRNASNP各被引用300多次。发展了转录因子和miRNA在复杂疾病中的共调控模块和网络研究(FFLtool),运用该方法发现了白血病和肿瘤微泡等研究中的重要调控因子。开发了基因集的癌症多组学分析平台GSCALite、特异表达基因工具SEGtool、T细胞丰度预测方法ImmuCellAI、癌症细胞系鉴定方法CCLA和TCR丰度预测方法CATT等。
发表论文70余篇,总引用5000余次(google)。近5年来以通讯作者在Nucleic Acids Research、Cancer Research、Cell Reports、Theranostics、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics等权威期刊发表论文近30多篇,包括多篇ESI高被引论文(2019.12月ESI网站显示高被引通讯作者论文3篇)。
2011年以来,先后主持国家自然科学基金5项,参与科技部重大项目2项。在国际上最大的计算生物学会议ISMB和全国各级生物信息大会做过邀请报告。担任系统生物学分会、医药生物信息技术分会、血液病精准诊疗专业委员会、中国抗癌协会非编码肿瘤标志物分会肿瘤测序与大数据分析专委会等多个协会委员、常委等。担任自然科学基金生命学部、医学部函评评委和精准医学重点研发会评评委。担任Scientific Reports等多个杂志的编委。
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H-Index: 59
G-Index: 132
Sociability: 7
Diversity: 4
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