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Topology-driven Negative Sampling Enhances Generalizability in Protein-Protein Interaction Prediction
Ayan Chatterjee,Babak Ravandi, Parham Haddadi, Naomi H Philip, Mario Abdelmessih, William R Mowrey, Piero Ricchiuto, Yupu Liang, Wei Ding, Juan Carlos Mobarec, Tina Eliassi-Rad
Bioinformatics (Oxford, England)no. 5 (2025)
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Topology-Driven Negative Sampling Enhances Generalizability in Protein-Protein Interaction Prediction
Ayan Chatterjee,Babak Ravandi, Naomi H. Philip, Mario Abdelmessih, William R. Mowrey, Piero Ricchiuto, Yupu Liang, Wei Ding, Juan C. Mobarec,Tina Eliassi-Rad
crossref（2024）
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Representation Learning of Human Disease Mechanisms for a Foundation Model in Rare and Common Diseases
Babak Ravandi, William R Mowrey,Ayan Chatterjee, Piero Ricchiuto, Parham Haddadi, Mario Abdelmessih, Wei Ding, Simon Lambden,Michael Ughetto,Ian Barrett,Tom Diethe,Guillermo Del Angel,Tina Eliassi-Rad
biorxiv（2024）
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