Su actividad investigadora se centra en el grupo de microorganismos conocidos como Pseudomonas, en concreto, desde el grupo de Degradación de Tóxicos Orgánicos, donde estudia las aplicaciones de estos microorganismos, entre ellos la especie P. putida, en los procesos de eliminación de contaminantes. También trabaja en las interacciones entre plantas y microorganismos con el objetivo de diseñar sistemas de biocontrol y biodegradación. Ha realizado más de 300 publicaciones en revistas científicas de todo el mundo, un centenar de comunicaciones en congresos y seminarios internacionales y más de medio centenar de colaboraciones en obras colectivas