先后参与、主持完成了30多项科研项目研究。在国家攻关与基础项目方面，连续承担了“六五”、“七五”、“八五”、“九五”攻关项目，承担完成的主要项目有《生态环境质量评价与典型区应用研究》（国家攻关项目，子专题负责人）、《湖泊（滇池）城市饮用水源地污染防治技术研究》（国家攻关项目，子专题负责人）、我国酸沉降及其生态环境影响（国家攻关项目，主要参加人）、环北京周边沙漠化数据库建设（公益性基础研究，负责人之一）、环境背景数据库建设（公益性基础研究，负责人之一）等；在为国家管理服务和决策科学研究方面，先后开展了黑河流域生态可持续发展研究（环保总局重大课题，主要参加人）、《西部生态调查》（环保总局重大课题，技术组组长）、《中东部生态调查》（环保总局重大课题，技术组组长）、《长江流域洪水易损性评估》（国际合作，技术组组长）、《长江流域自然保护与洪水控制》（国际合作，首席专家）、《我国酸沉降影响及对策研究》（国际合作，专题组组长）、《可持续农业发展》（国际合作，中方专家组组长）等科研、技术项目；在社会服务方面，开展了温岭、海门、围场等多个地区的生态示范区规划研究，烟台、满洲里、青岛等地区的生态环境保护规划研究；开展了若干自然保护区、重要生态功能区规划项目，其中不少课题获国家级或部级奖励，许多课题取得了明显的社会、经济和环境效益，为地方政府决策提供了科学基础。积极参与各种学术交流活动，担任生物多样性基金会副主任、生态经济学会常务副理事、生态学会、农业生态环境保护协会、资源与环境专业委员会理事。受国家人事部高级公务员培训中心委托，担任“新世纪科学发展与展望”环境与生态主讲人。博士论文《生态承载力理论、方法与应用》获中国科学院院奖，2001年被聘为中国环境科学研究院首批试点创新基地首席专家。撰写论著数部，发表中英文论文近百篇。