长期从事水稻优异种质创新利用和水稻高产、优质、抗逆基因的定位及遗传基础研究。主持国家863课题和国家自然科学基金重大国际合作项目。在优异种质的利用、新品种的选育和重要性状的基因定位等方面取得了重要进展；与钱前研究员等一起成功克隆了BC10、ALK、PHR1、NRL1等水稻功能基因。主要合作成果有：“水稻重要种质的创创新和应用”2010年和2009年分别获国家科技进步二等奖和浙江省科技进步一等奖；“中国农作物种质资源收集保存评价与利用”2003年获国家科技进步一等奖。在PNAS、New Phytologist、The Plant Journal和Annal of Botany等刊物上发表论文70余篇。