在国际高水平期刊Science、Science Bulletin、PNAS、ISME J、mBio、Mol Biol & Evol、Mol Ecol Resour等发表SCI论文数十篇，授权国际发明专利6项。主要研究方向为利用计算与实验生物学工具研究海洋微型生物对古代与现代海洋环境的适应，探索他们在生物地球化学循环（如碳、氮循环）中的作用。承担国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金中国-以色列合作项目、科技部国家重点研发计划项目等十余项科研项目。