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Bio
我们是生物信息学与遗传学实验相结合的研究团队,课题组设有干湿结合的长期和短期项目,欢迎对逻辑思考和科学研究有热情的同学联系实习或攻读研究生,也希望这一阶段的学习能够为同学未来的科研与职业生涯奠定良好的基础。
1. 以小麦为模式,研究转座子在多倍体进化中的作用。小麦起源于东亚新月沃地,其进化过程中经历多次基因组杂交加倍与转座子扩张事件,具备高度的环境适应性,成为全球分布最广的主粮作物。 McClintock在诺贝尔奖获奖致辞中推测,小麦族物种杂交后转座子爆发可能迅速推动新性状的获得。当转座子扩张遇到多倍化事件,会给基因组带来怎样的变化?不同时期不同类型的扩张,在选择压力下选取了怎样的进化路径?我们结合表观组、染色质高级结构刻画及调控组技术,在揭示转座子维持染色质稳定性、调控网络进化与分化等方面取得一系列有趣的进展。
2. 开发生物学技术挖掘和利用基因资源库。自然界存在大量基因资源,可以应用于作物改良和合成生物学。我们通过结合生物信息学策略,设计新的基因挖掘方案,充分利用天然存在的基因资源库。
3.以衣藻为底盘开展人类营养健康相关的合成生物学。莱茵衣藻是单细胞模式生物,在诱变、育种、高通量筛选方面操作方便,与传统微生物合成底盘相比,其蛋白修饰、代谢与动物更加接近。利用课题组的多学科优势,我们正在搭建体系,高效合成人类营养与健康相关的蛋白与化合物,也希望与志同道合的同学老师及创业团队有深入的交流合作。
1. 以小麦为模式,研究转座子在多倍体进化中的作用。小麦起源于东亚新月沃地,其进化过程中经历多次基因组杂交加倍与转座子扩张事件,具备高度的环境适应性,成为全球分布最广的主粮作物。 McClintock在诺贝尔奖获奖致辞中推测,小麦族物种杂交后转座子爆发可能迅速推动新性状的获得。当转座子扩张遇到多倍化事件,会给基因组带来怎样的变化?不同时期不同类型的扩张,在选择压力下选取了怎样的进化路径?我们结合表观组、染色质高级结构刻画及调控组技术,在揭示转座子维持染色质稳定性、调控网络进化与分化等方面取得一系列有趣的进展。
2. 开发生物学技术挖掘和利用基因资源库。自然界存在大量基因资源,可以应用于作物改良和合成生物学。我们通过结合生物信息学策略,设计新的基因挖掘方案,充分利用天然存在的基因资源库。
3.以衣藻为底盘开展人类营养健康相关的合成生物学。莱茵衣藻是单细胞模式生物,在诱变、育种、高通量筛选方面操作方便,与传统微生物合成底盘相比,其蛋白修饰、代谢与动物更加接近。利用课题组的多学科优势,我们正在搭建体系,高效合成人类营养与健康相关的蛋白与化合物,也希望与志同道合的同学老师及创业团队有深入的交流合作。
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WORLD JOURNAL OF MENS HEALTH (2025)
Yan Xue,Xiaofeng Cao,Xiangsong Chen,Xian Deng,Xing Wang Deng,Yong Ding,Aiwu Dong,Cheng-Guo Duan,Xiaofeng Fang,Lei Gong,Zhizhong Gong,Xiaofeng Gu,Chongsheng He,Hang He,Shengbo He,Xin-Jian He,Yan He,Yuehui He,Guifang Jia,Danhua Jiang,Jianjun Jiang,Jinsheng Lai,Zhaobo Lang,Chenlong Li,Qing Li,Xingwang Li,Bao Liu, Bing Liu,Xiao Luo,Yijun Qi,Weiqiang Qian,Guodong Ren,Qingxin Song,Xianwei Song,Zhixi Tian,Jia-Wei Wang, Yuan Wang,Liang Wu,Zhe Wu,Rui Xia,Jun Xiao,Lin Xu,Zheng-Yi Xu,Wenhao Yan,Hongchun Yang,Jixian Zhai,Yijing Zhang,Yusheng Zhao, Xuehua Zhong,Dao-Xiu Zhou,Ming Zhou,Yue Zhou, Bo Zhu,Jian-Kang Zhu,Qikun Liu
Science China Life Sciencespp.1-40, (2025)
FOOD CHEMISTRY (2025)
Shifei Sang, Xiaohan Sun, Tengyun Ma,Yijing Zhang, Guoqin Yao,Xinyu Wang, Xiaoyu Tan,Liuchun Feng, Junhua Li,Shengdong Ji,Hongtao Cheng
INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES (2025)
Journal of hazardous materials (2025): 137834-137834
Crop Designpp.100083, (2024)
NEW PHYTOLOGISTno. 1 (2024): 82-101
PLANT PHYSIOLOGYno. 4 (2024): 2400-2421
Juan Yi,Hong Su,Shilong Tian,Olga Sedelnikova, Yonghe Chen, Caiyao Zhao,Jianzhao Yang,Yijing Zhang,Xin-Guang Zhu,Jane A. Langdale,Jia-Wei Wang,Peng Wang
biorxiv(2024)
Xiaoning He, Chloe Dias Lopes, Leonardo Pereyra-Bistrain,Ying Huang,Jing An,Rim Brik Chaouche, Hugo Zalzale, Qingyi Wang, Xing Ma,Javier Antunez-Sanchez,Catherine Bergounioux, Sophie Piquerez,Sotirios Fragkostefanakis,Yijing Zhang,Shaojian Zheng,Martin Crespi,Magdy M. Mahfouz,Olivier Mathieu,Federico Ariel,Jose Gutierrez-Marcos,Xingwang Li,Nicolas Bouche,Cecile Raynaud,David Latrasse,Moussa Benhamed
NUCLEIC ACIDS RESEARCHno. 17 (2024): 10220-10234
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