主要从事雄激素对真核基因转录调控机制研究和睾丸生精过程中及附睾对精子成熟过程中的基因表达程序的调控，现集中在附睾功能基因组研究。该实验室由张友端教授在1978年建立，她于1989年退居二线做顾问后，由其学生张永莲教授担任课题组长。由于这是我国第一个从事这一飞速发展的领域的研究室。因此他们首先建立了各种激素受体的测定方法，并以培训班的形式向全国推广，以填补我国这一领域在研究和临床应用方面的空白。然后进行了雌激素受体的纯化，制备单克隆抗体等基础工作。同时筛选了研究激素作用原理的靶基因系统，通过对大鼠前列腺中PSBP基因表达的时空秩序以及雄激素影响下的特征，证明了它是研究雄激素对真核基因转录的调控机制的一个理想系统。通过对PSBP的C3基因启动子上的顺式调控元件和细胞核中的反式作用因子相互作用的研究，发现了启动子上的一些重要元件如：TATA盒和CCAAT盒上除了有一些通用因子与之作用外，还有组织特异的和雄激素调控相关的因子与之直接或间接地结合然后起协同作用。这些成果获得了1993年的中国科学院的自然科学一等奖，1997年国家自然科学三等奖。为了深入了解多元件，多因子的相互作用中的调控激发程序，该课题组进而开始研究基因转录活性与染色体结构的关系。